Citroën C5 Tourer wyposażony jest w elektryczną pokrywę bagażnika, która:
- otwiera się i zamyka w sposób automatyczny, za pomocą pilota zdalnego sterowania lub przycisków usytuowanych wewnątrz i na zewnątrz pojazdu;
- wyposażona jest w system antyprzytrzaskowy, który w momencie wykrycia przeszkody, ze względu na bezpieczeństwo użytkowników, przerywa zamykanie pokrywy.

Tylna kanapa w Citroënie C5 Tourer, składana w konfiguracji 2/3-1/3, uwalnia przestrzeń ładunkową z zupełnie płaską podłogą o łącznej objętości 1490 dm3 (533 dm3 w klasycznej konfiguracji).
Bagażnik posiada okazałe wymiary:
- długość maks. (przy złożonej kanapie) 1723 mm;
- wysokość maks. do dachu de 851 mm;
- szerokość maks. między nadkolami 1115 mm.

W Citroënie C5 Tourer funkcja regulacji wysokości progu bagażnika (dostępna w wersji z zawieszeniem Hydractive III+) umożliwia zmianę wysokości progu w zakresie 6 cm za pomocą przełącznika zlokalizowanego w prawej ścianie bagażnika.
Po uruchomieniu silnika, próg powraca do pozycji wyjściowej.

Citroën C5 Tourer proponuje dwa rodzaje siatek przytrzymujących ładunki:
- siatkę, która blokuje ładunki przy podłodze;
- siatkę z nawijaczem, mocowaną oparciami foteli przednich lub tylnych, która zapobiega przemieszczaniu się ładunków ze strefy ładunkowej do przedniej części kabiny w momencie nagłego hamowania.
Haczyki na torby dostępne są po obydwu stronach bagażnika.

Półka osłaniająca bagaż z automatycznym nawijaczem w modelu Citroëna C5 Tourer pozwala ukryć zawartość bagażnika przez ciekawskimi spojrzeniami z zewnątrz.

Citroën C5 Tourer poza klasycznym oświetleniem, bagażnik dysponuje przenośną lampką wbudowaną w jego prawą ścianę, która:
- w swoim mocowaniu, stanowi dodatkowe źródło światła;
- po wyjęciu z mocowania, w którym się ładuje, służyć może jako latarka funkcjonująca niezależnie przez 45 minut.